Prima di convertire un database FileMaker Pro, se ne deve pianificare scrupolosamente la conversione. I passi generali per la conversione dei file sono:
FileMaker Pro 12 è in grado di convertire soltanto i file creati con le versioni 7.x, 8.x, 9.x, 10.x e 11.x. (Per convertire i file precedenti a FileMaker Pro 7, vedere
Conversione dei database FileMaker Pro di versioni precedenti alla 7.x).
Se si convertono file, FileMaker Pro 12 conserva i contenuti dei file di origine e crea nuovi file convertiti in formato FileMaker Pro 12. I contenuti dei file di origine non vengono modificati ed è possibile aprirli nella precedente versione di FileMaker Pro che li ha creati. I file convertiti, invece, possono essere aperti solo in FileMaker Pro 12.